Publications HAL de rbardenet

2019

Journal articles

titre
Time-frequency transforms of white noises and Gaussian analytic functions
auteur
R. Bardenet, Adrien Hardy
article
Applied and Computational Harmonic Analysis, Elsevier, In press
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01855678/file/submitted.pdf BibTex
titre
Monte Carlo with Determinantal Point Processes
auteur
Rémi Bardenet, Adrien Hardy
article
Annals of Applied Probability, Institute of Mathematical Statistics (IMS), In press
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01311263/file/1605.00361v1.pdf BibTex

Conference papers

titre
A correspondence between zeros of time-frequency transforms and Gaussian analytic functions
auteur
R. Bardenet, Pierre Chainais, Julien Flamant, Adrien Hardy
article
SampTA 2019 - 13th International conference on sampling theory and applications, Aug 2019, Bordeaux, France
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02091672/file/1570525008.pdf BibTex
titre
On two ways to use determinantal point processes for Monte Carlo integration
auteur
Guillaume Gautier, R. Bardenet, Michal Valko
article
ICML workshop on Negative Dependence in Machine Learning, 2019, Long Beach, CA, United States
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02160382/file/icml_camera_ready.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Kernel quadrature with DPPs
auteur
Ayoub Belhadji, R. Bardenet, Pierre Chainais
article
2019
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https://arxiv.org/pdf/1906.07832 BibTex

2018

Journal articles

titre
Sinusoidal voltage protocols for rapid characterisation of ion channel kinetics
auteur
K. A. Beattie, A. P. Hill, R. Bardenet, Y. Cui, J. I. Vandenberg, D. J. Gavaghan, T. P. De Boer, And G. R. Mirams
article
Journal of Physiology, Wiley, In press
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BibTex
titre
On the zeros of the spectrogram of white noise
auteur
Rémi Bardenet, Julien Flamant, Pierre Chainais
article
Applied and Computational Harmonic Analysis, Elsevier, In press, pp.1-23
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01572207/file/submitted.pdf BibTex

Conference papers

titre
From random matrices to Monte Carlo integration via Gaussian quadrature
auteur
R. Bardenet, Adrien Hardy
article
IEEE Statistical Signal processing workshop, 2018, Freiburg, Germany
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01882393/file/final.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
A determinantal point process for column subset selection
auteur
Ayoub Belhadji, R. Bardenet, Pierre Chainais
article
2018
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01966298/file/1812.09771.pdf BibTex
titre
DPPy: Sampling Determinantal Point Processes with Python
auteur
Guillaume Gautier, Rémi Bardenet, Michal Valko
article
2018
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https://hal.inria.fr/hal-01879424/file/gautier2018dppy.pdf BibTex

2017

Journal articles

titre
On Markov chain Monte Carlo methods for tall data
auteur
Rémi Bardenet, Arnaud Doucet, Chris Holmes
article
Journal of Machine Learning Research, Journal of Machine Learning Research, 2017
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01355287/file/1505.02827v1.pdf BibTex
titre
On a few statistical applications of determinantal point processes
auteur
Rémi Bardenet, Frédéric Lavancier, Xavier Mary, Aurélien Vasseur
article
ESAIM: Proceedings and Surveys, EDP Sciences, 2017, 60
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01580353/file/submitted.pdf BibTex

Conference papers

titre
Zonotope hit-and-run for efficient sampling from projection DPPs
auteur
Guillaume Gautier, Rémi Bardenet, Michal Valko
article
International Conference on Machine Learning, 2017, Sydney, Australia
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https://hal.inria.fr/hal-01526577/file/gautier2017zonotope.pdf BibTex

2016

Journal articles

titre
Robust cell tracking in epithelial tissues through identification of maximum common subgraphs
auteur
Jochen Kursawe, Rémi Bardenet, Jeremiah Zartman, Alexander Fletcher, Ruth Baker
article
Journal of the Royal Society Interface, the Royal Society, 2016, ⟨10.1098/rsif.2016.0725 ⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01395088/file/20160725.full.pdf BibTex
titre
Hierarchical Bayesian inference for ion channel screening dose-response data
auteur
Ross H Johnstone, Rémi Bardenet, David J Gavaghan, Gary R Mirams
article
Wellcome Open Research, F1000Research, 2016, ⟨10.12688/wellcomeopenres.9945.1⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01580351/file/wellcomeopenres.9945.1.pdf BibTex

2015

Journal articles

titre
Uncertainty and variability in models of the cardiac action potential: Can we build trustworthy models?
auteur
Ross H Johnstone, Eugene T Y Chang, Rémi Bardenet, Teun P de Boer, David J Gavaghan, Pras Pathmanathan, Richard H Clayton, Gary R Mirams
article
Journal of Molecular and Cellular Cardiology, Elsevier, 2015
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BibTex
titre
Adaptive MCMC with online relabeling
auteur
Rémi Bardenet, Olivier Cappé, Gersende Fort, Balázs Kégl
article
Bernoulli, Bernoulli Society for Mathematical Statistics and Probability, 2015, 21 (3), p. 1304-1340. ⟨10.3150/13-BEJ578⟩
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https://arxiv.org/pdf/1210.2601 BibTex
titre
Ten Simple Rules for a Successful Cross-Disciplinary Collaboration
auteur
Bernhard Knapp, Rémi Bardenet, Miguel O. Bernabeu, Rafel Bordas, Maria Bruna, Ben Calderhead, Jonathan Cooper, Alexander G. Fletcher, Derek Groen, Bram Kuijper, Joanna Lewis, Greg Mcinerny, Timo Minssen, James Osborne, Verena Paulitschke, Joe Pitt-Francis, Jelena Todoric, Christian A. Yates, David Gavaghan, Charlotte M. Deane
article
PLoS Computational Biology, Public Library of Science, 2015, 11 (4), ⟨10.1371/journal.pcbi.1004214⟩
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BibTex
titre
Concentration inequalities for sampling without replacement
auteur
Rémi Bardenet, Odalric-Ambrym Maillard
article
Bernoulli, Bernoulli Society for Mathematical Statistics and Probability, 2015, 21 (3), pp.1361-1385. ⟨10.3150/14-BEJ605⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01216652/file/submittedArxiv.pdf BibTex

Conference papers

titre
Inference for determinantal point processes without spectral knowledge
auteur
Rémi Bardenet, Michalis Titsias
article
Neural Information Processing Systems (NIPS), Dec 2015, Montréal, Canada
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01245315/file/1507.01154v1.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
A note on replacing uniform subsampling by random projections in MCMC for linear regression of tall datasets
auteur
Rémi Bardenet, Odalric-Ambrym Maillard
article
2015
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01248841/file/arxiv.pdf BibTex

2014

Journal articles

titre
Probing the radio emission from air showers with polarization measurements
auteur
A. Aab, M. Avenier, C. Bérat, S. Le Coz, D. Lebrun, K. Louedec, F. Montanet, A. Stutz, M. Tartare, J. Aublin, P. Billoir, M. Blanco, L. Caccianiga, R. Gaior, P.L. Ghia, A. Letessier-Selvon, I.C. Mari S, M. Munchmeyer, Richard Dallier, Lilian Martin, R. Bardenet, D. Garcia-Gamez, Balázs Kégl, D. Monnier Ragaigne, I. Al Samarai, O. Deligny, I. Lhenry-Yvon, D. Martraire, F. Salamida, T. Suomijärvi
article
Physical Review D, American Physical Society, 2014, 89, pp.052002. ⟨10.1103/PhysRevD.89.052002⟩
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https://arxiv.org/pdf/1402.3677 BibTex

Conference papers

titre
Towards scaling up Markov chain Monte Carlo: an adaptive subsampling approach
auteur
Rémi Bardenet, Arnaud Doucet, Chris Holmes
article
International Conference on Machine Learning (ICML), 2014, Beijing, China. pp.405-413
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01254232/file/bardenet14.pdf BibTex

2013

Journal articles

titre
Ultrahigh Energy Neutrinos at the Pierre Auger Observatory
auteur
The Full Pierre Auger collaboration
article
Advances in High Energy Physics, Hindawi Publishing Corporation, 2013, 2013, pp.708680. ⟨10.1155/2013/708680⟩
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BibTex
titre
Constraints on the Origin of Cosmic Rays above 10^18 eV from Large-scale Anisotropy Searches in Data of the Pierre Auger Observatory
auteur
The Full Pierre Auger collaboration
article
Astrophysical Journal Letters, 2013, 762, pp.L13. ⟨10.1088/2041-8205/762/1/L13⟩
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https://arxiv.org/pdf/1212.3083 BibTex
titre
Bounds on the density of sources of ultra-high energy cosmic rays from the Pierre Auger Observatory
auteur
The Full Pierre Auger collaboration
article
Journal of Cosmology and Astroparticle Physics, Institute of Physics (IOP), 2013, 05, pp.009. ⟨10.1088/1475-7516/2013/05/009⟩
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https://arxiv.org/pdf/1305.1576 BibTex
titre
Identifying Clouds over the Pierre Auger Observatory using Infrared Satellite Data
auteur
The Full Pierre Auger collaboration
article
Astroparticle Physics, Elsevier, 2013, 50-52, pp.92-101. ⟨10.1016/j.astropartphys.2013.09.004⟩
Accès au bibtex
https://arxiv.org/pdf/1310.1641 BibTex
titre
Techniques for Measuring Aerosol Attenuation using the Central Laser Facility at the Pierre Auger Observatory
auteur
The Full Pierre Auger collaboration
article
Journal of Instrumentation, IOP Publishing, 2013, 8, pp.P04009. ⟨10.1088/1748-0221/8/04/P04009⟩
Accès au bibtex
https://arxiv.org/pdf/1303.5576 BibTex
titre
Interpretation of the Depths of Maximum of Extensive Air Showers Measured by the Pierre Auger Observatory
auteur
The Full Pierre Auger collaboration
article
Journal of Cosmology and Astroparticle Physics, Institute of Physics (IOP), 2013, 02, pp.026. ⟨10.1088/1475-7516/2013/02/026⟩
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https://arxiv.org/pdf/1301.6637 BibTex

Conference papers

titre
Highlights from the Pierre Auger Observatory
auteur
The Full Pierre Auger collaboration
article
33rd International Cosmic Ray Conference (ICRC2013), Jul 2013, Rio de Janeiro, Brazil
Accès au bibtex
https://arxiv.org/pdf/1310.4620 BibTex
titre
Collaborative hyperparameter tuning
auteur
R. Bardenet, M. Brendel, Balázs Kégl, M. Sebag
article
30th International Conference on Machine Learning (ICML 2013), Jun 2013, Atlanta, United States. pp.199-207
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http://hal.in2p3.fr/in2p3-00907381/file/bardenet13.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Pierre Auger Observatory and Telescope Array: Joint Contributions to the 33rd International Cosmic Ray Conference (ICRC 2013)
auteur
The Full Pierre Auger collaboration
article
2013
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https://arxiv.org/pdf/1310.0647 BibTex

2012

Journal articles

titre
Large-scale Distribution of Arrival Directions of Cosmic Rays Detected Above 10^18 eV at the Pierre Auger Observatory
auteur
The Full Pierre Auger collaboration
article
Astrophysical Journal Supplement, American Astronomical Society, 2012, 203, pp.34. ⟨10.1088/0067-0049/203/2/34⟩
Accès au bibtex
https://arxiv.org/pdf/1210.3736 BibTex
titre
A Search for Point Sources of EeV Neutrons
auteur
The Full Pierre Auger collaboration
article
Astrophysical Journal, American Astronomical Society, 2012, 760, pp.148. ⟨10.1088/0004-637X/760/2/148⟩
Accès au bibtex
https://arxiv.org/pdf/1211.4901 BibTex
titre
The Rapid Atmospheric Monitoring System of the Pierre Auger Observatory
auteur
The Full Pierre Auger collaboration
article
Journal of Instrumentation, IOP Publishing, 2012, 7, pp.P09001. ⟨10.1088/1748-0221/7/09/P09001⟩
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https://arxiv.org/pdf/1208.1675 BibTex
titre
Search for Point-like Sources of Ultra-high Energy Neutrinos at the Pierre Auger Observatory and Improved Limit on the Diffuse Flux of Tau Neutrinos
auteur
The Full Pierre Auger collaboration
article
Astrophysical Journal Letters, 2012, 755, pp.L4. ⟨10.1088/2041-8205/755/1/L4⟩
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BibTex
titre
A search for anisotropy in the arrival directions of ultra high energy cosmic rays recorded at the Pierre Auger Observatory
auteur
The Full Pierre Auger collaboration
article
Journal of Cosmology and Astroparticle Physics, Institute of Physics (IOP), 2012, 04, pp.040. ⟨10.1088/1475-7516/2012/04/040⟩
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BibTex
titre
Search for signatures of magnetically-induced alignment in the arrival directions measured by the Pierre Auger Observatory
auteur
The Full Pierre Auger collaboration
article
Astroparticle Physics, Elsevier, 2012, 35, pp.354-361. ⟨10.1016/j.astropartphys.2011.10.004⟩
Accès au bibtex
https://arxiv.org/pdf/1111.2472 BibTex
titre
Description of Atmospheric Conditions at the Pierre Auger Observatory using the Global Data Assimilation System (GDAS)
auteur
The Full Pierre Auger collaboration
article
Astroparticle Physics, Elsevier, 2012, 35, pp.591-607. ⟨10.1016/j.astropartphys.2011.12.002⟩
Accès au bibtex
https://arxiv.org/pdf/1201.2276 BibTex
titre
Erratum to "The Lateral Trigger Probability function for the Ultra-High Energy Cosmic Ray Showers detected by the Pierre Auger Observatory" [Astroparticle Physics 35 (2011) 266-276]
auteur
The Full Pierre Auger collaboration
article
Astroparticle Physics, Elsevier, 2012, 35, pp.681-684. ⟨10.1016/j.astropartphys.2012.02.005⟩
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BibTex
titre
Results of a self-triggered prototype system for radio-detection of extensive air showers at the Pierre Auger Observatory
auteur
The Full Pierre Auger collaboration
article
Journal of Instrumentation, IOP Publishing, 2012, 7, pp.P11023. ⟨10.1088/1748-0221/7/11/P11023⟩
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https://arxiv.org/pdf/1211.0572 BibTex
titre
Antennas for the Detection of Radio Emission Pulses from Cosmic-Ray induced Air Showers at the Pierre Auger Observatory
auteur
The Full Pierre Auger collaboration
article
Journal of Instrumentation, IOP Publishing, 2012, 7, pp.P10011. ⟨10.1088/1748-0221/7/10/P10011⟩
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https://arxiv.org/pdf/1209.3840 BibTex
titre
Measurement of the proton-air cross-section at $\sqrt{s}=57$ TeV with the Pierre Auger Observatory
auteur
The Full Pierre Auger collaboration
article
Physical Review Letters, American Physical Society, 2012, 109, pp.062002. ⟨10.1103/PhysRevLett.109.062002⟩
Accès au bibtex
https://arxiv.org/pdf/1208.1520 BibTex

Conference papers

titre
Monte Carlo methods
auteur
R. Bardenet
article
IN2P3 School of Statistics (SOS2012), May 2012, Autrans, France. pp.022002, ⟨10.1051/epjconf/20135502002⟩
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http://hal.in2p3.fr/in2p3-00846142/file/epjconf_sos2012_02002.pdf BibTex
titre
Adaptive Metropolis with online relabeling
auteur
R. Bardenet, O. CappÉ, Gersende Fort, Balázs Kégl
article
N. Lawrence, M. Girolami. Fifteenth International Conference on Artificial Intelligence and Statistics, Apr 2012, La Palma, Spain. 22, pp.91-99, 2012
Accès au texte intégral et bibtex
http://hal.in2p3.fr/in2p3-00698479/file/bardenet.pdf BibTex

Theses

titre
Towards adaptive learning and inference - Applications to hyperparameter tuning and astroparticle physics
auteur
Rémi Bardenet
article
Methodology [stat.ME]. Université Paris Sud - Paris XI, 2012. English
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00773295/file/Thesis.pdf BibTex

2011

Journal articles

titre
Search for ultrahigh energy neutrinos in highly inclined events at the Pierre Auger Observatory
auteur
The Full Pierre Auger collaboration
article
Physical Review D, American Physical Society, 2011, 84, pp.122005. ⟨10.1103/PHYSREVD.84.122005⟩
Accès au bibtex
BibTex
titre
Anisotropy and chemical composition of ultra-high energy cosmic rays using arrival directions measured by the Pierre Auger Observatory
auteur
The Full Pierre Auger collaboration
article
Journal of Cosmology and Astroparticle Physics, Institute of Physics (IOP), 2011, 06, pp.022. ⟨10.1088/1475-7516/2011/06/022⟩
Accès au bibtex
https://arxiv.org/pdf/1106.3048 BibTex
titre
Search for First Harmonic Modulation in the Right Ascension Distribution of Cosmic Rays Detected at the Pierre Auger Observatory
auteur
The Full Pierre Auger collaboration
article
Astroparticle Physics, Elsevier, 2011, 34, pp.627-639. ⟨10.1016/j.astropartphys.2010.12.007⟩
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BibTex
titre
The exposure of the hybrid detector of the Pierre Auger Observatory
auteur
The Full Pierre Auger collaboration
article
Astroparticle Physics, Elsevier, 2011, 34, pp.368-381. ⟨10.1016/j.astropartphys.2010.10.001⟩
Accès au texte intégral et bibtex
http://hal.in2p3.fr/in2p3-00528444/file/fermilab-pub-10-221-a-td.pdf BibTex
titre
Advanced functionality for radio analysis in the Offline software framework of the Pierre Auger Observatory
auteur
The Full Pierre Auger collaboration
article
Nuclear Instruments and Methods in Physics Research Section A: Accelerators, Spectrometers, Detectors and Associated Equipment, Elsevier, 2011, 635, pp.92-102. ⟨10.1016/j.nima.2011.01.049⟩
Accès au bibtex
https://arxiv.org/pdf/1101.4473 BibTex
titre
The Lateral Trigger Probability function for the Ultra-High Energy Cosmic Ray Showers detected by the Pierre Auger Observatory
auteur
The Full Pierre Auger collaboration
article
Astroparticle Physics, Elsevier, 2011, 35, pp.266-276. ⟨10.1016/j.astropartphys.2011.08.001⟩
Accès au bibtex
https://arxiv.org/pdf/1111.6645 BibTex
titre
The Pierre Auger Observatory scaler mode for the study of solar activity modulation of galactic cosmic rays
auteur
The Full Pierre Auger collaboration
article
Journal of Instrumentation, IOP Publishing, 2011, 6, pp.P01003. ⟨10.1088/1748-0221/6/01/P01003⟩
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BibTex
titre
The effect of the geomagnetic field on cosmic ray energy estimates and large scale anisotropy searches on data from the Pierre Auger Observatory
auteur
The Full Pierre Auger collaboration
article
Journal of Cosmology and Astroparticle Physics, Institute of Physics (IOP), 2011, 11, pp.022. ⟨10.1088/1475-7516/2011/11/022⟩
Accès au bibtex
https://arxiv.org/pdf/1111.7122 BibTex

Conference papers

titre
Algorithms for Hyper-Parameter Optimization
auteur
James Bergstra, R. Bardenet, Yoshua Bengio, Balázs Kégl
article
25th Annual Conference on Neural Information Processing Systems (NIPS 2011), Dec 2011, Granada, Spain
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/hal-00642998/file/draft1.pdf BibTex
titre
An adaptive Monte-Carlo Markov chain algorithm for inference from mixture signals
auteur
R. Bardenet, Balázs Kégl
article
14th International Workshop on Advanced Computing and Analysis Techniques in Physics Research (ACAT 2011), Sep 2011, Uxbridge, United Kingdom. pp.012044, ⟨10.1088/1742-6596/368/1/012044⟩
Accès au bibtex
BibTex
titre
The Pierre Auger Observatory V: Enhancements
auteur
The Full Pierre Auger collaboration
article
32nd International Cosmic Ray Conference (ICRC2011), Aug 2011, Beijing, China
Accès au bibtex
https://arxiv.org/pdf/1107.4807 BibTex
titre
The Pierre Auger Observatory I: The Cosmic Ray Energy Spectrum and Related Measurements
auteur
The Full Pierre Auger collaboration
article
32nd International Cosmic Ray Conference (ICRC2011), 2011, Beijing, China
Accès au bibtex
https://arxiv.org/pdf/1107.4809 BibTex
titre
The Pierre Auger Observatory II: Studies of Cosmic Ray Composition and Hadronic Interaction models
auteur
The Full Pierre Auger collaboration
article
32nd International Cosmic Ray Conference - ICRC 2011, 2011, Beijing, China
Accès au bibtex
https://arxiv.org/pdf/1107.4804 BibTex
titre
The Pierre Auger Observatory IV: Operation and Monitoring
auteur
The Full Pierre Auger collaboration
article
32nd International Cosmic Ray Conference - ICRC 2011, 2011, Beijing, China
Accès au bibtex
https://arxiv.org/pdf/1107.4806 BibTex
titre
The Pierre Auger Observatory III: Other Astrophysical Observations
auteur
The Full Pierre Auger collaboration
article
32nd International Cosmic Ray Conference - ICRC 2011, 2011, Beijing, China
Accès au bibtex
https://arxiv.org/pdf/1107.4805 BibTex

Poster communications

titre
Relabelling MCMC Algorithms in Bayesian Mixture Learning
auteur
R. Bardenet, Balázs Kégl, Gersende Fort
article
Snowbird Learning Workshop, Apr 2011, Fort Lauderdale, United States
Accès au texte intégral et bibtex
http://hal.in2p3.fr/in2p3-00590956/file/126.pdf BibTex

2010

Journal articles

titre
Update on the correlation of the highest energy cosmic rays with nearby extragalactic matter
auteur
The Full Pierre Auger collaboration
article
Astroparticle Physics, Elsevier, 2010, 34, pp.314-326. ⟨10.1016/j.astropartphys.2010.08.010⟩
Accès au bibtex
https://arxiv.org/pdf/1009.1855 BibTex

Conference papers

titre
Surrogating the surrogate: accelerating Gaussian-process-based global optimization with a mixture cross-entropy algorithm
auteur
R. Bardenet, Balázs Kégl
article
27th International Conference on Machine Learning (ICML 2010), Jun 2010, Haifa, Israel. pp.55-62
Accès au texte intégral et bibtex
http://hal.in2p3.fr/in2p3-00580438/file/Bardenet.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Radio spectrum measurements at Auger, part 2
auteur
Richard Dallier, R. Bardenet, S. Gambetta, H. Lyberis, C. Macolino
article
2010
Accès au bibtex
BibTex

2009

Poster communications

titre
Sampling-based optimization with mixtures
auteur
R. Bardenet, Balázs Kégl
article
OPT 2009: 2nd NIPS Workshop on Optimization for Machine Learning, Dec 2009, Whistler, Canada
Accès au texte intégral et bibtex
http://hal.in2p3.fr/in2p3-00580580/file/OPT2009-Bardenet.pdf BibTex